Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARF4P18085 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARF4P18085 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARF4P18085 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARF4P18085 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARF4P18085 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARF4P18085 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARF4P18085 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARF4P18085 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARF4P18085 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ARF4P18085 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARF4P18085 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARF4P18085 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARF4P18085 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARF4P18085 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF4P18085 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF4P18085 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF4P18085 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF4P18085 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF4P18085 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF4P18085 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF4P18085 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF4P18085 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF4P18085 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF4P18085 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF4P18085 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF4P18085 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF4P18085 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARF4P18085 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARF4P18085 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARF4P18085 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms