Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS1P17812 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms