Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKMT2P17540 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms