Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB1P16220 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB1P16220 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CREB1P16220 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB1P16220 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB1P16220 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB1P16220 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB1P16220 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB1P16220 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB1P16220 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB1P16220 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CREB1P16220 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB1P16220 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB1P16220 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB1P16220 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB1P16220 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB1P16220 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB1P16220 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB1P16220 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB1P16220 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB1P16220 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB1P16220 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB1P16220 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB1P16220 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB1P16220 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms