Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GFAPP14136 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFAPP14136 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFAPP14136 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFAPP14136 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFAPP14136 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GFAPP14136 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GFAPP14136 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GFAPP14136 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GFAPP14136 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GFAPP14136 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GFAPP14136 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFAPP14136 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFAPP14136 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFAPP14136 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFAPP14136 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFAPP14136 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFAPP14136 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFAPP14136 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFAPP14136 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFAPP14136 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFAPP14136 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFAPP14136 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GFAPP14136 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms