Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC130P13994 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms