Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CETPP11597 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CETPP11597 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CETPP11597 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CETPP11597 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CETPP11597 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CETPP11597 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CETPP11597 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CETPP11597 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CETPP11597 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CETPP11597 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CETPP11597 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CETPP11597 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CETPP11597 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CETPP11597 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CETPP11597 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CETPP11597 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CETPP11597 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CETPP11597 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CETPP11597 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CETPP11597 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CETPP11597 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CETPP11597 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CETPP11597 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CETPP11597 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CETPP11597 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CETPP11597 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CETPP11597 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CETPP11597 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CETPP11597 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CETPP11597 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CETPP11597 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CETPP11597 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CETPP11597 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CETPP11597 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CETPP11597 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CETPP11597 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CETPP11597 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CETPP11597 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CETPP11597 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CETPP11597 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CETPP11597 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CETPP11597 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CETPP11597 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CETPP11597 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CETPP11597 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CETPP11597 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CETPP11597 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CETPP11597 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CETPP11597 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CETPP11597 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CETPP11597 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CETPP11597 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CETPP11597 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CETPP11597 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CETPP11597 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CETPP11597 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CETPP11597 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CETPP11597 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CETPP11597 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CETPP11597 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CETPP11597 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CETPP11597 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CETPP11597 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CETPP11597 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CETPP11597 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CETPP11597 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CETPP11597 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CETPP11597 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CETPP11597 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CETPP11597 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CETPP11597 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CETPP11597 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CETPP11597 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CETPP11597 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CETPP11597 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CETPP11597 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CETPP11597 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CETPP11597 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms