Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARBP10826 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARBP10826 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARBP10826 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARBP10826 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARBP10826 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARBP10826 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARBP10826 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARBP10826 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARBP10826 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARBP10826 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARBP10826 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RARBP10826 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RARBP10826 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARBP10826 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARBP10826 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARBP10826 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARBP10826 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARBP10826 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARBP10826 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARBP10826 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARBP10826 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RARBP10826 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARBP10826 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARBP10826 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RARBP10826 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARBP10826 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARBP10826 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARBP10826 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARBP10826 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARBP10826 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARBP10826 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARBP10826 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARBP10826 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARBP10826 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARBP10826 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARBP10826 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARBP10826 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARBP10826 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARBP10826 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARBP10826 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms