Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GZMBP10144 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GZMBP10144 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GZMBP10144 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GZMBP10144 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GZMBP10144 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GZMBP10144 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GZMBP10144 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GZMBP10144 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GZMBP10144 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GZMBP10144 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GZMBP10144 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GZMBP10144 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GZMBP10144 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GZMBP10144 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms