Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBSLP0DN79 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CBSLP0DN79 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CBSLP0DN79 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBSLP0DN79 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBSLP0DN79 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBSLP0DN79 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBSLP0DN79 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CBSLP0DN79 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBSLP0DN79 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms