Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMIM10L2AP0DMW4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM10L2AP0DMW4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms