Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf89P0DMQ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf89P0DMQ9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms