Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP2CP0DJJ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRGAP2CP0DJJ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRGAP2CP0DJJ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms