Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA6AP0CW24 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms