Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms