Protein–RNA interactions for Protein: P09923

ALPI, Intestinal-type alkaline phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPIP09923 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPIP09923 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPIP09923 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPIP09923 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPIP09923 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPIP09923 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPIP09923 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPIP09923 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALPIP09923 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALPIP09923 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALPIP09923 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALPIP09923 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALPIP09923 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALPIP09923 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALPIP09923 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALPIP09923 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALPIP09923 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALPIP09923 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ALPIP09923 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALPIP09923 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms