Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD55P08174 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD55P08174 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD55P08174 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD55P08174 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD55P08174 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD55P08174 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD55P08174 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD55P08174 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD55P08174 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD55P08174 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD55P08174 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD55P08174 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD55P08174 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD55P08174 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD55P08174 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD55P08174 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms