Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSLP07711 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSLP07711 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSLP07711 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSLP07711 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSLP07711 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSLP07711 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSLP07711 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSLP07711 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSLP07711 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSLP07711 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSLP07711 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSLP07711 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSLP07711 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSLP07711 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSLP07711 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSLP07711 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms