Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCGP05129 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms