Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYBBP04839 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYBBP04839 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYBBP04839 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYBBP04839 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYBBP04839 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYBBP04839 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYBBP04839 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYBBP04839 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYBBP04839 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYBBP04839 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYBBP04839 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYBBP04839 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYBBP04839 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYBBP04839 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYBBP04839 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYBBP04839 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYBBP04839 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYBBP04839 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYBBP04839 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYBBP04839 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYBBP04839 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYBBP04839 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYBBP04839 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYBBP04839 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYBBP04839 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYBBP04839 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYBBP04839 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYBBP04839 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYBBP04839 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYBBP04839 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYBBP04839 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYBBP04839 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYBBP04839 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYBBP04839 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYBBP04839 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYBBP04839 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYBBP04839 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYBBP04839 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYBBP04839 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYBBP04839 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYBBP04839 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYBBP04839 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYBBP04839 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYBBP04839 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYBBP04839 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYBBP04839 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYBBP04839 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYBBP04839 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYBBP04839 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYBBP04839 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYBBP04839 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYBBP04839 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms