Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01737 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01737 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01737 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01737 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01737 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01737 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01737 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01737 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01737 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01737 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01737 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01737 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01737 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01737 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01737 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01737 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01737 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01737 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01737 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01737 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01737 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms