Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms