Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTXRO95502 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms