Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN3O95197 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN3O95197 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN3O95197 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN3O95197 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN3O95197 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN3O95197 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN3O95197 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN3O95197 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN3O95197 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN3O95197 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN3O95197 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN3O95197 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN3O95197 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN3O95197 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN3O95197 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms