Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOBTB3O94955 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms