Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLIT2O94813 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLIT2O94813 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLIT2O94813 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms