Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms