Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms