Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR3O43731 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR3O43731 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR3O43731 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms