Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN4O43707 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms