Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DENRO43583 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DENRO43583 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DENRO43583 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DENRO43583 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DENRO43583 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DENRO43583 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DENRO43583 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DENRO43583 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DENRO43583 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DENRO43583 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DENRO43583 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DENRO43583 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DENRO43583 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms