Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNA1GO43497 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1GO43497 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms