Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTRA2O43464 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms