Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI1O43347 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI1O43347 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI1O43347 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI1O43347 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI1O43347 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI1O43347 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI1O43347 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI1O43347 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI1O43347 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI1O43347 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI1O43347 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI1O43347 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI1O43347 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI1O43347 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI1O43347 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI1O43347 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI1O43347 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI1O43347 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI1O43347 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI1O43347 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI1O43347 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI1O43347 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI1O43347 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI1O43347 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI1O43347 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI1O43347 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MSI1O43347 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
MSI1O43347 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI1O43347 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms