Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSMD3O43242 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms