Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms