Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFRA2O00451 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms