Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN8O00124 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN8O00124 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN8O00124 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN8O00124 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBXN8O00124 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBXN8O00124 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN8O00124 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBXN8O00124 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN8O00124 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN8O00124 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN8O00124 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN8O00124 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN8O00124 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN8O00124 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms