Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H7C1W4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H7C1W4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H7C1W4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H7C1W4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H7C1W4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H7C1W4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H7C1W4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H7C1W4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H7C1W4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H7C1W4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
H7C1W4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H7C1W4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H7C1W4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H7C1W4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H7C1W4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H7C1W4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H7C1W4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C1W4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C1W4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C1W4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C1W4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C1W4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C1W4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C1W4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C1W4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
H7C1W4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H7C1W4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
H7C1W4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
H7C1W4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
H7C1W4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
H7C1W4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H7C1W4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H7C1W4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H7C1W4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H7C1W4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H7C1W4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H7C1W4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H7C1W4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H7C1W4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H7C1W4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H7C1W4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H7C1W4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H7C1W4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
H7C1W4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H7C1W4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
H7C1W4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H7C1W4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms