Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATL2C9JE40 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms