Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM1B2RUZ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms