Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms