Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC169A6NNP5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms