Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NL46 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A6NL46 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A6NL46 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A6NL46 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A6NL46 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A6NL46 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A6NL46 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A6NL46 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A6NL46 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A6NL46 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A6NL46 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NL46 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A6NL46 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NL46 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NL46 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NL46 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NL46 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NL46 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NL46 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NL46 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NL46 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NL46 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NL46 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NL46 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NL46 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A6NL46 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
A6NL46 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A6NL46 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
A6NL46 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms