Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms