Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE3A1L190 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE3A1L190 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms