Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLRN2A0PK11 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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