Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
A0A0U1RRA0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
A0A0U1RRA0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
A0A0U1RRA0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
A0A0U1RRA0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
A0A0U1RRA0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
A0A0U1RRA0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
A0A0U1RRA0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
A0A0U1RRA0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
A0A0U1RRA0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
A0A0U1RRA0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms