Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZC3H12C-203ENST00000528673 2931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MELK-206ENST00000536329 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 OR10H5-202ENST00000642092 7044 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC00974-201ENST00000456403 2141 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL512662.2-201ENST00000453174 1963 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZNF859P-201ENST00000502859 1966 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ICK-202ENST00000356971 6227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC02069-201ENST00000457449 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 DEPDC1-201ENST00000370966 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZFYVE1-203ENST00000553891 3244 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC011458.2-201ENST00000603937 207 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SLC16A1-AS1-207ENST00000627431 1073 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ITGAM-201ENST00000287497 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC022107.1-201ENST00000624833 3094 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MFAP3L-201ENST00000361618 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TAF1A-203ENST00000366890 1648 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LDLRAD1-204ENST00000545928 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TIFAB-201ENST00000537858 5923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ATCAY-205ENST00000600960 2904 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 APOL2-201ENST00000249066 2685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 C11orf54-214ENST00000540113 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 APOL4-202ENST00000332987 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PRAMEF11-201ENST00000619922 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RANBP3-202ENST00000340578 3233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 GRIK1-205ENST00000399909 3427 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC037471.1-201ENST00000554586 1699 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC127381.2-201ENST00000560680 1699 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PLA2G4C-219ENST00000599111 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AP002495.1-204ENST00000529844 1781 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PITRM1-203ENST00000380994 2579 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 DACH2-202ENST00000373131 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LARP4-206ENST00000518444 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TGFA-201ENST00000295400 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL121574.1-201ENST00000415890 419 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC122683.1-201ENST00000456335 717 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RPS19P3-201ENST00000480487 441 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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