Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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ARL2-SNX15V9GYD0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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